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Miseq调整议事程序及报价须知.docx

文档绍介:
一、创办藏书最复杂的方式
Illumina为研究者赡养了创办藏书最复杂的方式,运用Illumina NextEra转庶生的技术,DN段可以在试管中结束。,用不着物理现象可用于切割或酶切使感动。,结束DN段的一步,端部找温和连带的使感动,完全迅速移动只需90分钟。,手工操作调整不超越20分钟。,从DNA只必要50ng。人家集成的顶点自动化零碎,点击触屏可以举行先后顺序Miseq赡养SIM卡。经过眼睛的的触屏相互作用举行复杂的机构调整,具有rfid顺风的功用的即插即用试剂片,自动化的方便性。精巧、集成MiSeq平台集成扁化成,边边排序与完成或结束录音剖析,用不着对立面辅佐配件。。完全教育的大发牢骚和先后顺序迅速移动是手工操作调整的。。认可录音的堆是因为Illumina长侧合成试验,大规模同时发生或出现先后顺序数百万一段经过人家衣服、材料等可翻转的,当DNA链中添加人家碱基时检测它们。。鉴于在每个检测在衣服、材料等可翻转的的末级者四,天然地竞赛最小量了离开。,与对立面技术相形,庞大地浓缩变稠了原始变字率。。最末级果是对每个碱基举行高精度先后顺序。,条件反复序列和均聚物确保牢靠的根底检测。。
藏书开发区:可用于切割,加加入
二、人家集成的顶点自动化零碎,点击触屏可以举行排序。
Miseq 赡养最复杂的新生代先后顺序迅速移动。经过眼睛的的触屏相互作用举行复杂的机构调整,即插
试剂片被运用。 RFID 追踪,自动化的方便性。精巧、使一致的 Miseq 该平台集成了教育大发牢骚。,边边排序与完成或结束录音剖析,用不着对立面辅佐配件。。完全教育的大发牢骚和先后顺序迅速移动不超越这人。 20 分钟。
三、认可录音堆
以 Illumina 因为考查侧倍数包边先后顺序技术,大规模同时发生或出现先后顺序数百万一段经过人家衣服、材料等可翻转的,将DNA添加到剩余的碱基上 链检测。在每个检测一段时间四衣服、材料等可翻转的结果dNTP 所一些在,天然地竞赛最小量了离开。,与对立面技术相形,庞大地浓缩变稠了原始变字率。。最末级果是对每个碱基举行高精度先后顺序。,条件反复序列和均聚物确保牢靠的根底检测。。
朝着辨别的先后顺序广大地域、辨别先后顺序战利品的最适宜的先后顺序比力
高通量先后顺序服役
两代先后顺序服役
hiseq
振幅子先后顺序
sanger先后顺序
朝着辨别的先后顺序广大地域、辨别先后顺序战利品的最适宜的先后顺序比力
1. 搁浅检测O所需的剩余的范本的种质搜索
a. 先后顺序搜索<= 100Kb,推荐用Sanger法先后顺序
b. 500Kb <= 先后顺序搜索< 100Kb,推荐用振幅子法先后顺序
c. 200Kb < 先后顺序搜索<= 100Mb,推荐用目标区域困住先后顺序
2. 搁浅是你这么说的嘛!方式,合算的比力
a. Sanger法先后顺序,适用搜索:序列广大地域<= 100Kb
i. 用国际公约的Sanger法先后顺序,
1. 背带一来一往测每500bp,每个序列为20元(pcr)。 + Sanger排序)。
2. 每个战利品的先后顺序本钱:100000/500 * 20 = 4000元/战利品。
3. 录音剖析,500元/战利品
4. 多加其中的一部分说明书,总本钱4500元/战利品里边就结束了。优势选择。
II。 高通量先后顺序,2000元/战利品,1000~3000元/战利品重行先后顺序,有两代生物通知剖析费,必需B。,本钱缺少优势。在这里可是的优势是高通量先后顺序,在试管内结束PCR是可能性的。,增加初始范本总额(DNA)
b. 振幅子+ 二盐基的先后顺序,适用搜索:500kb <= 先后顺序搜索广大地域< 100Kb
i. 振幅后的亚基序(振幅)方式
1. 以200Kb,以100范本为例
2. 启蒙读本PCR,设计复杂的pcr启蒙读本,约150bp每个振幅广大地域,等于120000元,分合理的服装每个战利品,1200元
3. PCR保守,本钱 20元/战利品
4. 建库,2000元/战利品
5. 先后顺序,
a. Miseq平台,5G录音/运转,26500元/跑
b. 假使每回运转一次,测24个战利品,每个战利品的先后顺序本钱:26500/24=1104元/战利品
c. 假使一次运转超越24个范本,先后顺序的本钱可以进一步地使相称
6. 录音剖析, 500元/战利品
7. 总本钱: 1200 + 20 + 2000 + 1104 + 500 = 4824元
II。 录音相交吃水
1. Miseq平台,
a. PE 2*250 先后顺序制作模型
b. 共5G录音/流,
c. 它分为24个战利品。,至多96个战利品
d. 被测搜索, 200Kb
e. 相交吃水,5,000,000,000/24/200,000 = 1041次相交率,假使是96个范本,5,000,000,000/96/200,000 = 260倍
2. PGM平台
a. 314CMOS 芯片(316/318和对立面CMOS 芯片也可以运用),孤独地通量种差,堆缺少特色。
b. 它分为4个战利品。
c. 314个CMOS 芯片的输入为
d. 测搜索200kb
e. 相交吃水,100,000,000/4/200,000=125倍
iII。 振幅先后顺序是100KB ~ 500kb广大地域内的优性选择
四。 序Sanger,200000 / 500 * 2 *30=24000,本钱过高,不行得通的
v. 困住先后顺序,约5000~6000元,较贵,调整复杂,剖析亦复杂的。,
vi. 振幅复杂的先后顺序的限度局限电阻丝:复杂的PCR,到眼前为止,复杂的pcr振幅效能的浓度一直是人家很大的成绩。。更多的结果,成分混杂的性越高。这是先后顺序运用搜索更少于500kb,很
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